Indice de similarité de Jaccard (Jaccard index)

Indice de similarité de Jaccard (Jaccard index)
Définit la similitude comme étant l’importance de remplacement des espèces ou les changements biotiques à travers les gradients environnementaux. Il permet une comparaison entre deux sites, car il évalue la ressemblance entre deux relevés en faisant le rapport entre les espèces communes aux deux relevés et celles propres à chaque relevé. Il a pour formule :

I = Nc / (N1 + N2 - Nc)

Nc : nombre de taxons commun aux stations 1 et 2
N1 et N2 : nombre de taxons présents respectivement aux stations 1 et 2

Cet indice I varie de 0 à 1 et ne tient compte que des associations positives. Si l’indice I augmente, un nombre important d’espèces se rencontre dans les deux habitats évoquant ainsi que la biodiversité inter habitat est faible (conditions environnementales similaires entre les habitats). Dans le cas contraire, si l’indice diminue, seul un faible nombre d’espèces est présent sur les deux habitats. Ainsi, les espèces pour les deux habitats comparés sont totalement différentes indiquant que les différentes conditions de l’habitat déterminent un turn-over des espèces importantes.

Indice de similarité de Morisita-Horn (Morisita-Horn index)
Contrairement aux indices de similarité de Sørensen et de Jaccard qui s’appliquent sur les données de présence-absence, l’indice de similarité de Morisita-Horn s’applique aux données quantitatives. Il permet d’évaluer la similarité entre les différents groupes et n’est pas influencé par la richesse spécifique et l’effort d’échantillonnage. Sa formule est :

CMH = 2 ∑▒((ai x bi))/((da+db)x(Na x Nb))                               

da = ∑ai2/Na2

db = ∑bi2/Nb2

Na = nombre total d’individus au site a
Nb = nombre total d’individus au site b 
ai = nombre d’individus de l’espèce i au site a
bi = nombre d’individus de l’espèce i au site b

Sa valeur est comprise entre 0 (communautés dissemblables) et 1 (similarité maximale). Deux groupes sont semblables (faible diversité) si la valeur de CMH est supérieure à 0,5 et dissemblables si cette valeur est inférieure à 0,5 (diversité élevée).

Read More

Indice biotique

Indice biotique (ou biologique) global normalisé (IBGN) (normalized global biotic index) 
Cet indice normalisé AFNOR (1992) a pour but de d’évaluer la tendance évolutive de la qualité des eaux des écosystèmes lotiques à partir d’indicateurs biologiques des eaux pures et des eaux polluées. Il constitue une information synthétique exprimant l’aptitude d’un cours d’eau courante au développement des invertébrés benthiques toutes causes confondues. Il permet un classement objectif des qualités biogènes de sites appartenant à des systèmes différents, naturels, modifiés, artificiels ou diversement dégradés.

Cette méthode permet de situer la qualité biologique d’un site en dehors de toute présomption relative à la nature d’une quelconque perturbation. Elle permet d’évaluer l’effet d’une modification du milieu de type naturel (affluence, modification du substrat, réchauffement des eaux…) ou provoquée artificiellement (rejet, recalibrage du lit…). Elle est utilisée pour compléter les techniques usuelles de qualification et de détection des sources de perturbation (analyse physico-chimique des eaux, par exemple) par une indication ayant une signification différente, puisque visant à caractériser les perturbations par leurs effets et non par leurs causes, et plus globale puisque traduisant à la fois les caractéristiques de l’eau et du substrat. Quelques notions complémentaires doivent ici être présentées :

IBGN-1 ou Robustesse
Notion permettant d’aborder la fiabilité de la note IBGN ou IBGA obtenu. La robustesse se calcule de la même manière que l’indice auquel elle se rapproche, mais sans prendre en compte le premier taxon indicateur. Iv’=Iv-1 et In’=In du deuxième taxon indicateur. Le deuxième taxon indicateur peut être de même groupe faunistique indicateur que le premier. Il se caractérise par une note sur 20. C’est l’écart entre la robustesse et l’Indice IBGN ou IBGA qui détermine la fiabilité de la note et la qualité de l’appréciation du site.

Indice variété, Iv
Classe de qualité qui traduit la diversité faunistique observée dans l’échantillon, la variété faunistique étant le nombre de taxons différents inventoriés sur un échantillonnage.

Indice nature, In
Classe de polluosensiblité du Groupe faunistique Indicateur ou Groupe Indicateur (Groupe de taxons indicateur appartenant à une même classe de polluosensibilité. Ces classes s’échelonnent de 1 à 9 du plus polluorésistant au plus polluosensible) observé sur la station étudiée. Il traduit la qualité de l’eau de la station. Plus la station est soumise à des pollutions, plus l’In est faible.

Read More