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Indice de similarité de Jaccard (Jaccard index)

Indice de similarité de Jaccard (Jaccard index)
Définit la similitude comme étant l’importance de remplacement des espèces ou les changements biotiques à travers les gradients environnementaux. Il permet une comparaison entre deux sites, car il évalue la ressemblance entre deux relevés en faisant le rapport entre les espèces communes aux deux relevés et celles propres à chaque relevé. Il a pour formule :
I = Nc / (N1 + N2 - Nc)
Nc : nombre de taxons commun aux stations 1 et 2
N1 et N2 : nombre de taxons présents respectivement aux stations 1 et 2
Cet indice I varie de 0 à 1 et ne tient compte que des associations positives. Si l’indice I augmente, un nombre important d’espèces se rencontre dans les deux habitats évoquant ainsi que la biodiversité inter habitat est faible (conditions environnementales similaires entre les habitats). Dans le cas contraire, si l’indice diminue, seul un faible nombre d’espèces est présent sur les deux habitats. Ainsi, les espèces pour les deux habitats comparés sont totalement différentes indiquant que les différentes conditions de l’habitat déterminent un turn-over des espèces importantes.
Indice de similarité de Morisita-Horn (Morisita-Horn index)
Contrairement aux indices de similarité de Sørensen et de Jaccard qui s’appliquent sur les données de présence-absence, l’indice de similarité de Morisita-Horn s’applique aux données quantitatives. Il permet d’évaluer la similarité entre les différents groupes et n’est pas influencé par la richesse spécifique et l’effort d’échantillonnage. Sa formule est :
CMH = 2 ∑▒((ai x bi))/((da+db)x(Na x Nb))                               
da = ∑ai2/Na2
db = ∑bi2/Nb2
Na = nombre total d’individus au site a
Nb = nombre total d’individus au site b 
ai = nombre d’individus de l’espèce i au site a
bi = nombre d’individus de l’espèce i au site b
Sa valeur est comprise entre 0 (communautés dissemblables) et 1 (similarité maximale). Deux groupes sont semblables (faible diversité) si la valeur de CMH est supérieure à 0,5 et dissemblables si cette valeur est inférieure à 0,5 (diversité élevée).


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